Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
HOXA3O43365 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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