Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HHLA1C9JL84 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms