Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ERVK-18Q9QC07 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms