Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHPF2Q9P2E5 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms