Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms