Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SH3GL2Q99962 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms