Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms