Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HDAC11Q96DB2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HDAC11Q96DB2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms