Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBXN4Q92575 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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