Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NUP35Q8NFH5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NUP35Q8NFH5 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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