Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
SYCNQ0VAF6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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