Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABPAQ06546 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GABPAQ06546 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms