Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms