Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN10P78369 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN10P78369 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLDN10P78369 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms