Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1LP55160 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms