Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXD10P28358 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXD10P28358 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms