Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC063977.2-201ENST00000601996 421 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 IGLJ1-201ENST00000390320 127 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2AP24928 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms