Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT1P21579 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms