Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CALCOCO1Q9P1Z2 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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