Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQL9

DMRT3, Doublesex- and mab-3-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMRT3Q9NQL9 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
DMRT3Q9NQL9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms