Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D2

CEP295, Centrosomal protein of 295 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295Q9C0D2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 CACNA1C-AS1-203ENST00000544517 742 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR1249-201ENST00000408671 66 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC010163.1-201ENST00000434440 520 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CEP295Q9C0D2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms