Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CNPPD1Q9BV87 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CNPPD1Q9BV87 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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