Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SIRT1Q96EB6 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SIRT1Q96EB6 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms