Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APTXQ7Z2E3 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APTXQ7Z2E3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms