Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CENPPQ6IPU0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms