Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 FGFR1OP-207ENST00000622353 3451 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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LINC01545Q5VT33 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
LINC01545Q5VT33 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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