Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDRF1Q3B7T1 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EDRF1Q3B7T1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms