Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNA1SQ13698 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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