Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CGNL1Q0VF96 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms