Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
E2F1Q01094 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms