Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP1Q00587 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms