Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PTCH1-207ENST00000429896 6563 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ERVK-16P61578 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms