Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ACTBP60709 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ACTBP60709 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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