Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBASH3AP57075 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms