Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 TRAPPC4-212ENST00000533058 1209 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TOP2AP11388 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms