Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 SLC35A5-207ENST00000494706 840 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AP000943.2-201ENST00000544019 644 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC074032.1-201ENST00000548468 698 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC00629-202ENST00000592070 844 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC244517.2-201ENST00000607216 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC097717.1-251ENST00000608419 183 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 KRT18P50-201ENST00000404337 1243 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC073472.1-201ENST00000441433 803 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CNIH1-207ENST00000557690 838 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC136624.3-201ENST00000571660 567 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC025682.1-204ENST00000580045 733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATXN8OSP0DMR3 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms