Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KCNN4O15554 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms