Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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