Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1E9PL57 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms