Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ODF3BA8MYP8 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms