Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
KCNIP3Q9Y2W7 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms