Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ19

ANKRD60, Ankyrin repeat domain-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD60Q9BZ19 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ANKRD60Q9BZ19 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms