Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CUL5-201ENST00000393094 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL162391.1-201ENST00000419853 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX5-201ENST00000358127 8615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 BDP1-201ENST00000358731 11073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms