Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF397Q8NF99 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF397Q8NF99 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms