Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms