Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PLD3Q8IV08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms