Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SCXQ7RTU7 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms