Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 NAT8B-201ENST00000377712 765 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTF1AQ7RTS3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTF1AQ7RTS3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms