Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRIP1Q5VSL9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms