Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SKOR2Q2VWA4 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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